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Horticulture Research| DAP-seq技術(shù)助力揭示MeJA緩解桃果實(shí)冷害的分子機(jī)制

更新時(shí)間:2026-03-30   點(diǎn)擊次數(shù):116次

2025年11月3日,Chinese Academy of Agricultural Sciences鄭州果樹(shù)研究所桃遺傳育種團(tuán)隊(duì)在Horticulture Research(IF = 8.5)上發(fā)表了一篇題為“JAZ2/JAZ4-MYC2.1 Module Mediates MeJA-Induced Alleviation of Chilling Injury in Peach Fruit (Prunus persica)"的研究論文。該文章借助DAP-seq技術(shù),揭示了JAZ2/JAZ4-MYC2.1模塊介導(dǎo)MeJA緩解桃果實(shí)冷害的分子機(jī)制。藍(lán)景科信為該研究提供了DAP-seq技術(shù)支持

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Prunus persica)作為典型的躍變型果實(shí),因風(fēng)味佳、營(yíng)養(yǎng)豐富占據(jù)重要市場(chǎng)地位,但采后冷藏易引發(fā)冷害(CI),表現(xiàn)為表面凹陷、內(nèi)部褐變(IB)、成熟受阻等癥狀,其中內(nèi)部褐變主要由酚類物質(zhì)的酶促氧化導(dǎo)致,嚴(yán)重降低果實(shí)商品性。茉莉酸甲酯(MeJA)作為植物信號(hào)分子,已被證實(shí)可增強(qiáng)多種果實(shí)的耐冷性,其作用與乙烯合成、抗氧化能力提升等生理過(guò)程相關(guān),但MeJA介導(dǎo)桃果實(shí)耐冷性的分子機(jī)制,尤其是關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子MYC2的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及JAZ蛋白的調(diào)控作用,尚未明確。

主要研究結(jié)果

核心發(fā)現(xiàn)一:生理層面驗(yàn)證MeJA冷功效

采用1 mM MeJA浸泡處理‘CP9’桃果實(shí)15 min,4℃冷藏28天并系統(tǒng)檢測(cè)冷害癥狀及生理指標(biāo)。結(jié)果表明,MeJA處理顯著抑制果實(shí)內(nèi)部褐變(IB)發(fā)展,顯著提高乙烯釋放量,同時(shí)促進(jìn)茉莉酸(JA)和JA-Ile積累;果實(shí)中總酚、類黃酮等抗氧化物質(zhì)含量顯著升高,丙二醛(MDA)、活性氧(ROS)積累速率及多酚氧化酶(PPO)、過(guò)氧化物酶(POD)活性顯著降低,有效緩解低溫誘導(dǎo)的氧化損傷和組織劣變。

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圖1 外源茉莉酸甲酯(MeJA)處理緩解桃果實(shí)冷害(CI)癥狀

核心發(fā)現(xiàn)二:基因組水平解析核心轉(zhuǎn)錄因子PpMYC2.1調(diào)控桃果實(shí)耐冷三重響應(yīng)通路

1、鎖定PpMYC2.1為冷核心調(diào)控因子

通過(guò)對(duì)MeJA處理組和對(duì)照組不同冷藏時(shí)間的果實(shí)進(jìn)行RNA-seq分析,鑒定差異表達(dá)基因(DEGs),并結(jié)合系統(tǒng)發(fā)育分析、組織特異性表達(dá)譜檢測(cè)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),兩個(gè)MYC2(茉莉酸信號(hào)分子開(kāi)關(guān))同源基因中,僅PpMYC2.1MeJA處理和冷藏期間被持續(xù)顯著誘導(dǎo),且其表達(dá)量與乙烯合成、多酚和類黃酮積累呈正相關(guān),而PpMYC2.2表達(dá)量低且呈負(fù)相關(guān)。免疫印跡分析證實(shí),MeJA處理可誘導(dǎo)PpMYC2.1蛋白積累,且亞細(xì)胞定位顯示PpMYC2.1定位在細(xì)胞核。以上結(jié)果表明,PpMYC2.1是MeJA誘導(dǎo)桃果實(shí)耐冷性的重要調(diào)控因子,通過(guò)整合調(diào)控乙烯信號(hào)通路和抗氧化物質(zhì)合成發(fā)揮作用。

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圖2 PpMYC2.1在茉莉酸甲酯(MeJA)介導(dǎo)的桃果實(shí)茉莉酸(JA)信號(hào)通路中發(fā)揮作用

2、全基因組鑒定PpMYC2.1靶基因

為鑒定PpMYC2.1的靶基因,研究開(kāi)展了DNA親和純化測(cè)序(DAP-seq)。結(jié)果顯示PpMYC2.1在桃基因組中存在9752個(gè)高置信度結(jié)合峰,主要富集于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TSS)上游1000bp區(qū)域,其結(jié)合基序?yàn)镃AC[G/A]TG,與經(jīng)典G-box基序高度相似進(jìn)一步結(jié)合RNA-seq數(shù)據(jù)分析獲得1920個(gè)PpMYC2.1直接靶基因GO富集分析顯示這些基因顯著富集于苯丙烷生物合成過(guò)程、JA介導(dǎo)的信號(hào)通路、乙烯響應(yīng)及細(xì)胞壁大分子分解代謝過(guò)程,涉及乙烯合成、細(xì)胞壁降解和苯丙烷代謝等關(guān)鍵通路

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圖3 DAP-seq與RNA-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析鑒定到受PpMYC2.1調(diào)控的直接靶基因

3PpMYC2.1調(diào)控三大耐冷關(guān)鍵通路

通過(guò)DAP-seq和RNA-seq聯(lián)合分析,篩選乙烯信號(hào)通路關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子(PpIAA1、PpERF61、PpHB.G7細(xì)胞壁降解相關(guān)基因(PpPL1PpPG2PpXTH2)以及苯丙烷代謝途徑關(guān)鍵基因(PpPAL1Pp4CLPpCHI3PpCHS通過(guò)Y1H、EMSA、DLR及桃果實(shí)瞬時(shí)過(guò)表達(dá)和沉默實(shí)驗(yàn)證實(shí),PpMYC2.1可直接結(jié)合上述基因的啟動(dòng)子區(qū)域并調(diào)控其表達(dá),表明PpMYC2.1在介導(dǎo)MeJA誘導(dǎo)的桃果實(shí)耐冷性中發(fā)揮核心作用。

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圖4 PpMYC2.1介導(dǎo)的桃果實(shí)乙烯合成相關(guān)關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子(TFs)的直接調(diào)控

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圖5 PpMYC2.1介導(dǎo)的桃果實(shí)細(xì)胞壁降解關(guān)鍵基因的直接調(diào)控

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圖6 PpMYC2.1介導(dǎo)的桃果實(shí)多酚和類黃酮合成關(guān)鍵基因的直接調(diào)控

核心發(fā)現(xiàn)三:PpJAZ2/4-MYC2.1模塊調(diào)控機(jī)制與PpMYC2.1冷功能的多維驗(yàn)證

1PpJAZ2/4-PpMYC2.1模塊在介導(dǎo)MeJA誘導(dǎo)的桃果實(shí)冷適應(yīng)中的功能

JAZ-MYC模塊是JA信號(hào)通路中的核心調(diào)控機(jī)制,其中JAZ蛋白作為抑制因子,通過(guò)直接結(jié)合并抑制MYC轉(zhuǎn)錄因子(TFs)的活性,進(jìn)而調(diào)控下游基因表達(dá)。通過(guò)系統(tǒng)篩選桃基因組JAZ家族基因,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析、蛋白水平檢測(cè)鎖定PpJAZ2/4為候選調(diào)控因子。利用酵母雙雜交(Y2H)、熒光素酶互補(bǔ)成像(LCI)、雙分子熒光互補(bǔ)(BiFC)及免疫共沉淀(Co-IP)等實(shí)驗(yàn)證實(shí),PpJAZ2/4PpMYC2.1存在直接物理相互作用,且二者均定位于細(xì)胞核;雙熒光素酶報(bào)告基因(DLR)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步表明,PpJAZ2/4可顯著抑制PpMYC2.1對(duì)下游靶基因啟動(dòng)子的激活活性,而MeJA處理能顯著下調(diào)PpJAZ2/4的轉(zhuǎn)錄與蛋白水平,解除其對(duì)PpMYC2.1的抑制效應(yīng)。

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圖7 PpJAZ2/4抑制PpMYC2.1對(duì)其下游靶基因的轉(zhuǎn)錄活性

2、PpMYC2.1跨物種功能驗(yàn)證

為驗(yàn)證PpMYC2.1在調(diào)控冷害中的功能作用,本研究構(gòu)建PpMYC2.1過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因番茄,株系,并對(duì)野生型和轉(zhuǎn)基因番茄果實(shí)進(jìn)行4℃冷藏28天處理,檢測(cè)冷害癥狀及相關(guān)理化和分子指標(biāo)。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)基因番茄冷害指數(shù)顯著低于WT,乙烯合成量顯著提升,果實(shí)硬度適度下降,MDA和ROS積累減少,總酚、類黃酮含量升高,且乙烯合成(SlACS2SlACO1)、細(xì)胞壁降解(SlPL1SlXTH3)及苯丙烷代謝(SlPAL1SlCHS1)相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平顯著上調(diào)。以上結(jié)果表明,PpMYC2.1的耐冷功能在不同果實(shí)物種中具有保守性。

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圖8 轉(zhuǎn)基因番茄果實(shí)中PpMYC2.1過(guò)表達(dá)增強(qiáng)耐冷性

小結(jié)

本研究通過(guò)多組學(xué)技術(shù)(RNA-seq、DAP-seq)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)相結(jié)合,完整揭示了“MeJA下調(diào)PpJAZ2/4表達(dá)→解除對(duì)PpMYC2.1的抑制→激活乙烯合成、細(xì)胞壁重塑及多酚類黃酮合成通路→增強(qiáng)果實(shí)冷性"的分子調(diào)控鏈。這一發(fā)現(xiàn)不僅填補(bǔ)MeJA介導(dǎo)桃果實(shí)耐冷害分子機(jī)制的研究空白,更為躍變型果實(shí)采后冷鏈物流優(yōu)化提供了關(guān)鍵分子靶點(diǎn),為開(kāi)發(fā)高效、綠色的保鮮技術(shù)奠定了堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)。

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圖9 闡明PpMYC2.1在提升耐冷性中正向調(diào)控作用的工作模型

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